O apartamento 302
Henry Townshend vive no South Ashfield Heights, apartamento 302. Por cinco dias, sua porta permanece acorrentada por dentro, as janelas não podem ser abertas, telefone e televisão não o conectam ao exterior. Um grande buraco surge na parede do banheiro e se torna a única saída possível. Ao atravessá-lo, Henry entra em mundos desconectados e hostis.
As primeiras vítimas
No mundo do metrô, Henry conhece Cynthia Velasquez, que acredita estar sonhando. Ela é assassinada e sua morte é confirmada no mundo real. O padrão se repete com Jasper Gein, Andrew DeSalvo e Richard Braintree. Números gravados nos corpos e documentos encontrados por Henry apontam para o antigo serial killer Walter Sullivan.
Joseph e os 21 Sacramentos
O antigo morador do apartamento, o jornalista Joseph Schreiber, investigava Walter e o orfanato Wish House, administrado pelo culto de Silent Hill. Walter foi criado acreditando que o apartamento 302 — lugar onde foi abandonado quando bebê — era sua “mãe”. A doutrina dos 21 Sacramentos oferece a ele uma forma de “purificar” e reunir-se com essa mãe: uma sequência ritual de assassinatos.
Walter adulto e Walter criança
Embora Walter tenha morrido, sua consciência persiste no mundo criado pelo ritual. Henry encontra tanto o Walter adulto, assassino praticamente imortal, quanto uma manifestação infantil que representa a parte inocente e carente do personagem. O objetivo do Walter adulto é concluir as vítimas restantes. Eileen Galvin está marcada como a vigésima; Henry é o número 21.
Eileen e o apartamento corrompido
Walter ataca Eileen, mas ela sobrevive e passa a acompanhar Henry. Ao mesmo tempo, o apartamento 302 — inicialmente o único lugar relativamente seguro — começa a ser tomado por assombrações. Henry e Eileen descem cada vez mais fundo pelos mundos conectados e encontram o espírito de Joseph, que explica que Walter precisa ser destruído para quebrar o ritual.
Cordão umbilical e confronto final
Henry obtém o cordão umbilical de Walter, preservado pelo superintendente Frank Sunderland, e descobre que o objeto é essencial para tornar Walter vulnerável. No fim, Eileen é atraída pela influência do assassino para uma máquina ritualística. Henry enfrenta Walter enquanto tenta impedir que ela complete o trajeto até a morte. O destino de Eileen e o nível de corrupção do apartamento determinam o final.