Ebisugaoka, década de 1960
Hinako vive em uma cidade rural japonesa e se sente aprisionada pelas expectativas da família. O pai é abusivo, a mãe se submete a ele e a irmã mais velha, Junko, já deixou a casa após se casar. Depois de uma discussão, Hinako encontra Shu, Rinko e Sakuko. Shu lhe oferece cápsulas vermelhas para aliviar fortes dores de cabeça.
Flores, névoa e morte
Uma figura usando shiromuku aparece e a cidade é coberta por névoa e flores vermelhas. Sakuko morre diante do grupo. Ebisugaoka se transforma e criaturas passam a ocupar ruas e edifícios. Durante a jornada, Hinako perde a consciência repetidas vezes e desperta em outro plano: o Dark Shrine.
Fox Mask
No santuário, Hinako é acompanhada por Fox Mask, que parece protegê-la e orientá-la. Uma presença ligada à boneca de infância de Hinako insiste que ele não é confiável. Enquanto isso, no mundo da cidade, Hinako tenta reencontrar Shu e Rinko e descobrir uma rota de fuga. A ponte está destruída, e o grupo planeja usar caminhos nas montanhas.
Infância e casamento
As passagens entre Ebisugaoka e o Dark Shrine tornam-se cada vez menos separadas. Hinako é confrontada com memórias da família, da relação com os amigos, do medo de crescer e, especialmente, da perspectiva de casamento. Jogadas posteriores deixam mais claro que seu destino envolve um casamento arranjado com Tsuneki Kotoyuki, a identidade por trás de Fox Mask, dentro de uma tradição do clã.
Duas Hinako
A história passa a apresentar versões conflitantes da protagonista: uma Hinako humana e uma identidade ligada à raposa e à cerimônia. As duas linhas começam a se sobrepor. A forma de raposa participa de atos violentos e do caminho até o casamento, enquanto a parte humana resiste. A relação entre liberdade, dever, desejo, tradição e as cápsulas vermelhas muda conforme a rota.
O primeiro final e a releitura
Coming Home to Roost é o único final disponível na primeira jogada. Hinako rejeita a forma de raposa e o casamento, mas entra em pânico e abusa das cápsulas. O epílogo recontextualiza os acontecimentos e mostra Hinako mais velha, fugindo após violência ocorrida em sua cerimônia de casamento. New Game+ abre novas informações que demonstram que a primeira leitura não é a única explicação para tudo o que aconteceu.
As rotas adicionais
Fox’s Wedding leva Hinako a aceitar o casamento, mas às custas de sua liberdade. The Fox Wets its Tail a coloca contra Kotoyuki e permite seu retorno com Shu. Ebisugaoka in Silence, liberado depois de outros finais, reconcilia as duas versões de Hinako, revela forças ancestrais manipulando também Kotoyuki e permite que os dois rompam o casamento e a maldição. The Great Space Invasion! é o tradicional final cômico de UFO.